Bütün EB növlərinin dəri mikrobiomu (2023)

Bu layihədə aşkar edilən yeni biliklər dəridə hansı mikrobların (bakteriyalar, göbələklər və viruslar) yaşadığını təsvir edir. Sayı və növü dərinin "mikrobiomunu" təşkil edir. Müxtəlif növ EB olan və olmayan insanların blisterli və qabarıqsız dərisinin mikrobiomunda dəyişiklikləri müqayisə edərək, yaraların sağalması zamanı dəyişən nümunələri müəyyən etdi.

Qan nümunələrindən alınan immun hüceyrələrinin (neytrofillər) xüsusilə JEB-də daha aktiv olduğu aşkar edildi, buna görə də bu hüceyrələrin davranışını sakitləşdirən dərmanlar potensial müalicə kimi araşdırıla bilər.

EB-si olmayan insanların blister mayesində tapılan və EB-li insanlarda olmayan xüsusi bir protein də müalicələr üçün yeni bir hədəf ola bilər.

2023-cü ilin dekabrında Prof Chapple DEBRA UK tərəfindən maliyyələşdirilən işin nəticələrini dərc etdi Qovşaq epidermoliz büllozunda genotip-fenotip korrelyasiyası: şiddətə işarələr. Bu barədə də məlumat verilib geniş auditoriya üçün məqalə.

“Tədqiqatımız dəri mikrobiomunun, blister protein tərkibinin və EB-də neytrofil funksional davranışının sağalma rolu haqqında mövcud anlayışı inkişaf etdirdi. Bu, pre- və probiotiklərin inkişafı kimi yeni sarğı və balanslaşdırıcı müalicələrin inkişafına səbəb ola bilər.

Prof Iain Chapple

94 dəri yaxma nümunəsi toplanıb və mikrobiom analizinə başlanılıb. İlkin nəticələr bədənin müxtəlif hissələrində yaşayan bakteriyaların növlərində fərqi və EB olmayan insanlarla müqayisədə DEB və JEB olan insanların dərisindəkilər arasında fərqi göstərir.

Hansı immun sistem zülallarının (sitokinlərin) artdığını və ya azaldığını müəyyən etmək üçün EB blister mayesinin 16 nümunəsi toplanmış və tədqiq edilmişdir. Bu, immun reaksiyanın bəzi EB növlərində sağalmaq əvəzinə zərər verə biləcəyinə dair bəzi sübutlar təqdim etdi.

A plakat 2022-ci ilin mayında Tədqiqatçı Dermatoloqlar Cəmiyyətində bu günə qədərki tərəqqinin ümumiləşdirilməsi təqdim edildi.

Aparıcı tədqiqatçı: Professor Iain Chapple Periodontologiya professoru və Böyük Britaniyanın Birmingem Universitetinin Stomatologiya fakültəsinin rəhbəri və bərpaedici stomatologiya üzrə məsləhətçidir.

O, Birmingem Periodontal Tədqiqat Qrupunun bir hissəsi kimi güclü komandaya rəhbərlik edir və Birmingem Universitetində Klinik Elmlər İnstitutunun Tədqiqat direktorudur. Iain, Məsləhətçi Dermatoloq və EB eksperti Prof Adrian Heagerty ilə sıx əməkdaşlıqda yetkin EB xəstələri üçün milli klinik ağız və diş müalicəsini idarə edir. Iain tədqiqatlarına görə 2012-ci ildə Kral Cərrahlar Kolleci tərəfindən Çarlz Tomes medalı ilə təltif edilib və həmçinin 2018-ci ildə Diş Tədqiqatları Beynəlxalq Assosiasiyası Periodontal Tədqiqatlar üzrə Görkəmli Alimdir.

Tədqiqatçılar: Dr Sarah Kuehne, Dr Josefine Hirschfeld, Dr Melissa M Grant və Prof Adrian Heagerty

“Biz DEBRA-nın 2019-cu il DEBRA Üzvlərinin Həftəsonunda EB xəstələrimizin və nümayəndələrimizin güclü dəstəyini və marağını nəzərə alaraq, bu layihə üçün DEBRA-nın maliyyələşdirməsindən son dərəcə həyəcanlıyıq. Bu, bizə dəridə hansı bakteriyaların yaşadığı və yaraları kolonizasiya etdiyi və onların immun sistemimizin onlara necə reaksiya verdiyi və blisterlərin necə sağalmasına təsir göstərə biləcəyi ilə bağlı əsas suallara cavab verməyə imkan verəcək. Nəhayət, ümid edirik ki, bu, gələcəkdə terapiyaya yeni yanaşmaların işlənib hazırlanmasına kömək edəcək”.

Prof Iain Chapple

Bu layihə haqqında daha çox məlumat əldə etmək üçün siz DEBRA Üzvlərinin Həftəsonu 2018 təqdimatına buradan baxa bilərsiniz

Qrantın adı: Epidermoliz bülloza xəstələrində dəri mikrobiomunun xarakteristikası və neytrofil funksiyasının tədqiqi.

Nə araşdırılır?
Bu tədqiqat epidermoliz bülloza (EB) olan insanların dərisində mövcud olan müxtəlif bakteriyaları araşdıracaq. İnsan bədənində insan hüceyrələri ilə müqayisədə iki dəfə çox bakteriya hüceyrələri var, buna görə də biz əslində insan və bakteriya elementlərinin kompleks qarışığıyıq və sağlamlıq üçün immunitet sistemimizin bakteriyalarımızla harmoniyada yaşaması tələb olunur. Bu bakteriyaların əksəriyyəti dostdur. Bununla belə, EB yaralarında bakteriyalar dəyişə bilər və infeksiyalara səbəb ola bilər, yaraların sağalmasını gecikdirir, nəticədə çapıqlar yaranır. Hal-hazırda EB olan insanların dərisində yaşayan bakteriyalar yaxşı bilinmir. Bu qrup EB olan insanların dərisində hansı bakteriyaların olduğunu və onların necə davrandığını araşdırmağı planlaşdırır.

Bu niyə araşdırılır?
İnsan bədənində infeksiyalardan qorunmaq üçün xüsusi immunitet hüceyrələri var. Onların rolu bizi xəstə edə biləcək hər hansı yad hüceyrələri və ya bakteriyaları tapmaq və məhv etməkdir. Sağlamlıq baxımından, immunitet sistemimizlə kifayət qədər xoşbəxt yaşayan sağlamlığı təşviq edən bakteriyalarımız var, lakin ətraf mühit dəyişərsə (məsələn, blister yaradan travma) müxtəlif bakteriyalar böyüməyə başlaya bilər və bu da immunitet sistemimizi poza bilər. . Bəzi xəstəliklərdə, bu baş verdikdə, immunitet hüceyrələri lazım olduğu kimi işləmir və bəzi bakteriyalara həddindən artıq reaksiya verə bilər, bu da toxumalarımızı zədələyə və yaraların sağalmasını gecikdirə bilər.

Niyə bu vacibdir?
Bu tədqiqat neytrofillər adlanan xüsusi immun hüceyrələrin epidermoliz büllozasında (EB) düzgün işlədiyini anlamaq üçün açardır. EB-dən təsirlənən bir çox insanlar tez-tez bir sıra infeksiyalardan əziyyət çəkirlər və bu, onların immun sisteminin səmərəli işləməyə biləcəyinə işarədir. Neytrofillərin necə işlədiyinin tədqiqi onların pozucu bakteriyaları təmizləmək qabiliyyətini təkmilləşdirə bilən müalicə variantlarının layihələndirilməsinə dəlil gətirə bilər ki, bu da sağlam bakteriyaların geri qayıtmasına və “sağlam” bakteriyalarımızla immun sistemimiz arasında vacib tarazlığı bərpa etməsinə imkan verir.
Bu iki aspekt öyrəniləcək, çünki digər xəstəliklərdə bakteriyaların və onlara qarşı immun reaksiyalarının bir-biri ilə sıx əlaqəli olduğu məlumdur. Həm bakteriya, həm də immunitet hüceyrələri dərinin sağalmasına təsir edən siqnallar buraxır, bu da dəriyə zərər verə bilər və bizi digər infeksiyalara daha həssas edə bilər. Həmçinin dərini sağaltmağa kömək edən siqnallar və ya “molekulyar” mesajlar olacaq və bunların daha yaxşı başa düşülməsi zərərli siqnalları dayandıran, lakin faydalı olanları gücləndirən müalicələrin inkişafını asanlaşdıracaq. Bu tədqiqat sahələrini bir araya gətirməklə, biz gələcəkdə EB olan insanlarda yaraların sağalması üçün effektiv müalicə variantlarının inkişaf etdirilməsinə ümid edirik.

Dərinin xarici səthində bakteriyalar, göbələklər və viruslar kimi bir çox mikrob yaşayır, əksəriyyəti zərərsiz və dostdur. Bununla belə, blisterə səbəb olan travma olduqda, bu mikroblar fərqli davranaraq infeksiyalara səbəb ola bilər, yaraların sağalmasını çətinləşdirə və yara izləri yarada bilər. İnsan bədənində bizi infeksiyalardan qoruyan və onlarla mübarizə aparmağa kömək edən, mikrobları aşkar edərək onları məhv edən xüsusi immun hüceyrələri var ki, yaralar sağalsın.

Bəzi xəstəliklərdə immun hüceyrələr lazım olduğu kimi davranmır və müəyyən mikroblara həddindən artıq reaksiya verə bilər, bu da yaraların sağalmasının gecikməsinə və yan təsir olaraq öz toxumalarımızı zədələyə bilər. Layihəmiz EB-də dəridə hansı mikrobların məskunlaşdığını, yaraların sağalması zamanı dəyişdiklərini və EB olan insanlarda spesifik bir immun hüceyrə növü olan neytrofilin düzgün işlədiyini öyrənmək məqsədi daşıyırdı. EB ənənəvi olaraq yüngül travma ilə dəri qabarması ilə nəticələnən irsi bir vəziyyət kimi düşünülür. Bununla belə, biz təklif edirik ki, EB-də dəri yaralarının gec sağalması qismən bu əsas immun hüceyrələrin düzgün işləməməsi ilə nəticələnə bilər.

Dəri mikroblarının tədqiqi mürəkkəb ola bilər. Əvvəla, dəridə mikrobların sayının az olması səbəbindən hər hansı bir analiz aparmaq üçün onlardan nümunə götürmək texniki cəhətdən çətindir. İkincisi, mikrob icmaları bütün bədəndə tərkibində dəyişir: əllərdəki dəri mikrobiomunun tərkibi ayaqların birindən fərqlidir. Beləliklə, pambıq çubuqlar kimi düzgün nümunə götürmə üsulundan istifadə etdiyimizə və EB xəstələrindən nümunə götürməzdən əvvəl mikrobları müəyyən edə bildiyimizə əmin olmalıyıq.

Metodlarımızın işlədiyini sübut etdikdən sonra yaxma dəstləri təqdim etdik və EB olan və olmayan insanlardan mikrobları dərilərindən tampona köçürə bilməsi üçün blister əmələ gələndə dəri çubuqlarını götürmələrini istədik. Barkod kimi işləyən DNT-yə baxaraq, hansı orqanizmlərin mövcud olduğunu və nə etdiklərini deyə bildik.

Biz nəinki təsirlənməmiş dəri üzərində müşahidələr apardıq, həm də blisterlərin dərisində fərqləri və yaraların sağalması zamanı bu icmaların necə dəyişdiyini müşahidə etdik. Biz aşkar etdik ki, EB xəstələrinin dərisində “bacillales” adlanan xüsusi qrupa aid daha çox mikrob var və bu qrupun tərkibi hər EB alt növü üçün spesifik olub. Biz həmçinin EB olan insanların dərisində yaşayan göbələklərdə və yaraların sağalması zamanı bunların necə dəyişdiyini gördük.

Layihəmizin başqa bir vacib cəhəti, blisterlərdə nə baş verdiyini və EB-li insanların immun sisteminin mikroblara necə reaksiya verdiyini başa düşməkdir. Biz könüllülərimizdən blisterlərdən maye toplamaq istədik və onlardakı zülalları araşdırmaq və ölçmək üçün blister mayesini təhlil etdik. Bu zülallarda blisterlərin necə əmələ gəldiyi və ya sağalması barədə bizə məlumat verə biləcək potensial fərqlərin olduğunu göstərdik. Xüsusilə, EB olan insanlarda tapılmayan, lakin vəziyyəti olmayan insanlarda tapılan vacib bir protein müəyyən etdik. İndi bu zülalın rolunu və onun yeni müalicə hədəfinin diqqət mərkəzində olub-olmadığını başa düşməyə çalışırıq. Biz həmçinin təhlil edilmiş bütün müxtəlif növ blister mayeləri üçün zülal imzaları aşkar etdik ki, bu da EB alt tipləri arasındakı fərqləri izah etməyə imkan verir.

Biz qanda olan xüsusi immun hüceyrə növü olan neytrofillərin davranışındakı fərqləri qeyd etdik. Bu hüceyrələr infeksiya və yaraların sağalması zamanı ilk cavab verənlərdir və EB olan xəstələrdə onların bakterial stimullara necə reaksiya verdiyini müşahidə etdik. Xüsusilə qovşaq EB-dən təsirlənən insanlarda vəziyyəti olmayan insanlarla müqayisədə yüksək neytrofil reaksiyaları tapdıq. Bu şişirdilmiş davranış ev sahibinin toxuma zədələnməsi ilə əlaqələndirilir və həmçinin yaraların sağalmasının azalmasını izah edə və ya kömək edə bilər. Bu təsirlər bu cür zərərin qarşısını alan təbii məhsullarla yüngülləşdirilə bilər ki, bu da başqa bir yeni müalicə metodunu təmsil edə bilər.

Əldə etdiyimiz tapıntılar EB xəstələrinin dərisində hansı mikrobların məskunlaşdığını, yaraların sağalması zamanı onların necə dəyişdiyini və orqanizmin bakteriyalara necə reaksiya verdiyini üzə çıxarıb. Bu yeni biliklər sayəsində sağlam və funksional dəri florasını bərpa etmək üçün pre- və probiotiklər və/yaxud antioksidant mikroelementlərdən istifadə etməklə yeni müalicə üsulları və ya yara sarğıları hazırlamaq mümkün ola bilər. EB və yara iyileşmesini təşviq etməyə kömək edir. (2023-cü ilin yekun tərəqqi hesabatından.)

• Pandemiya tədbirləri yüngülləşdirildikdən sonra EB olan xəstələrin qeydiyyatı tamamlandı.
• EB mikrobiomu üçün DNT ekstraksiyasına təsir edə və təsir edə bilən dəyişənlər müəyyən edilmiş və sınaqdan keçirilmiş və EB xəstələrinin təhlili üçün optimal protokol müəyyən edilmişdir.
• Müəyyən edilmiş protokol 94 dəri yaxma nümunəsini toplamaq və çıxarmaq üçün istifadə edilmişdir.
• 44 nümunə ardıcıllıq və bioinformatik analizlərdən keçib. Bunların qismən təhlili qovşaq EB və ya distrofik EB-dən təsirlənən insanların mikrobiomu ilə sağlam fərdlər arasında fərqi nümayiş etdirdi.
• EB-də dəri mikrobiomu haqqında tam məlumat əldə etmək üçün bədən yerləri nəzərə alınmalıdır.
• Qalan nümunələr uğurla emal edilib və ardıcıllaşdırılıb və hazırda bioinformatika analizlərindən keçir.
• Biz sitokin tərkibi və proteaz aktivliyi üçün 16 blister maye nümunəsini təhlil etdik.

İnsan dərisində bakteriyalar, göbələklər və viruslar kimi bir çox mikrob məskunlaşır, onların əksəriyyəti zərərsiz və dostdur. Bununla belə, dəri blisterinə səbəb olan travma olduqda, bu mikroblar fərqli davranaraq infeksiyalara səbəb ola bilər, yaraların sağalmasını çətinləşdirə və yara izləri yarada bilər.

İnsan orqanizmində bizi infeksiyalardan qoruyan və onlara qarşı mübarizə aparan, mikrobları aşkar edərək onları məhv edən xüsusi immun hüceyrələri var. Bəzi xəstəliklərdə immun hüceyrələr lazım olduğu kimi davranmır və müəyyən mikroblara həddindən artıq reaksiya verə bilər, bu da yaraların sağalmasının gecikməsinə və yan təsir olaraq öz toxumalarımızı zədələyə bilər.

Layihəmiz EB-də dəridə hansı mikrobların məskunlaşdığını, müəyyən bir immun hüceyrə növü olan neytrofilin EB-li insanlarda düzgün işlədiyini və blisterlərdə olan zülalların EB-də necə dəyişdiyini öyrənmək məqsədi daşıyır.

Məlumat verilmiş araşdırmada biz dəridə yaşayan mikroblara baxmaq metodunu optimallaşdırdıq və ondan EB olan və olmayan insanlardan dəri çubuqlarını toplamaq üçün istifadə etdik. Biz yaxma dəstləri təqdim etdik və insanlardan mikrobları dərilərindən tampona ötürə bilmələri üçün blister əmələ gələndə dəri çubuqları götürmələrini istədik. Barkod funksiyasını yerinə yetirən DNT-yə baxaraq, hansı orqanizmlərin mövcud olduğunu və nə etdiklərini söyləyə biləcəyik.

Analiz edilməli olan 94 nümunəmiz var və biz bu uzun və mürəkkəb analizin yarısından çoxunu keçirmişik. Məlumatlara ilk baxışdan biz müşahidə etdik ki, distrofik EB-dən təsirlənən insanlar, vəziyyəti olmayan insanlardan fərqli mikrobioma malikdirlər. Xüsusilə, bir qrup bakteriya, proteobakteriyalar dəri problemi olan insanlarda daha çox olur. Biz qovşaq EB-dən təsirlənən insanlarda oxşar tendensiya müşahidə etdik. JEB-dən təsirlənən insanların dərisində hansı orqanizmlərin məskunlaşdığını daha ətraflı nəzərdən keçirərək, biz həmçinin blisterin hansı bədən yerində əmələ gəldiyini nəzərə almağın vacibliyini vurğuladıq. Əslində, ayaq biləyinin mikrobiomu, hətta EB olmayan insanlarda da qolun mikrobiomundan çox fərqli görünürdü. Buna görə də, eyni bədən yerindən nümunələri müqayisə etmək çox vacibdir.

Təhlillərimizə davam etdikcə, EB olan insanların mikrobiomu haqqında daha geniş məlumat əldə edəcəyik və biz bakteriyaların potensial funksiyalarını və buna görə də potensial yeni terapevtik hədəfləri müəyyən edə biləcəyik.

Bundan əlavə, biz EB olan xəstələrin blisterlərində olan zülalları araşdırdıq. Biz göstərdik ki, bu zülallarda blisterlərin necə əmələ gəldiyi və ya sağalması barədə bizə məlumat verə biləcək potensial fərqlər var. Bunu araşdırmaq üçün daha çox iş gedir. (2022-ci il tərəqqi hesabatından).