Bu veb saytda çerezlərdən istifadə edir ki, mümkün olan ən yaxşı istifadəçi təcrübəsini təmin edə bilərik. Cookie məlumatları brauzerinizdə saxlanılır və veb saytımıza qayıtdıqda və sizi maraqlandıran və faydalı olan saytın hansı bölmələrini anlamaqda kömək etmək üçün sizi tanıdığınız funksiyaları yerinə yetirir.
Bütün EB növləri üçün sadələşdirilmiş genetik test
EB genlərinin ardıcıllaşdırılması üçün daha ucuz, daha sürətli üsul ailələrə xəstəliyin təsiri haqqında daha geniş anlayış və müvafiq dəstəyə çıxış imkanı verən erkən diaqnoz demək ola bilər.
Dr Ene-Choo Tan Sinqapurda EB simptomları olan 12-15 nəfərin genetik testə razılıq verdikdən sonra kiçik qan nümunəsi verəcəyi bir xəstəxanada işləyir. Bu layihə tez dəqiq nəticələr əldə etməyin ən yaxşı yolunu müəyyən etmək və təkmilləşdirmək üçün müxtəlif üsullardan istifadə etməklə EB-də iştirak etdiyi bilinən genləri ardıcıllıqla sıralayacaq.
Daha ətraflı tədqiqatçımızın bloqunda oxuyun.
Şəkil krediti: Milli İnsan Genomu Tədqiqat İnstitutu (NHGRI).
Maliyyələşdirməmiz haqqında
Tədqiqat rəhbəri | Doktor Ene-Çu Tan |
Müəssisə | KK Qadın və Uşaq Xəstəxanası, Sinqapur |
EB növləri | Bütün növ EB |
Xəstə cəlb | 12-15 nəfər EB üçün genetik testdən keçirilməlidir |
Maliyyələşdirmə məbləği | £10,500 |
Layihənin uzunluğu | 1 il |
Başlanğıc tarixi | 1 mart 2024 |
DEBRA daxili ID | GR000044 |
Proje detayları
Tədqiqatçılar EB xəstələrinin diaqnostikası və idarə edilməsində yerli həkimlərlə işləmək üçün müxtəlif Cənub-Şərqi Asiya ölkələrinə səfər ediblər. Onlar köhnə, qısa oxunan ardıcıllıq texnologiyası tərəfindən qaçırılan genetik dəyişiklikləri aşkar etmək üçün daha yeni, uzun müddət oxunan ardıcıllıq texnologiyasından istifadə edirlər.
Aparıcı tədqiqatçı: Dr Tan, Viskonsin-Madison Universitetində Elmlər üzrə Magistr dərəcəsi və Molekulyar və Hüceyrə Biologiyası İnstitutundan PhD dərəcəsi ilə molekulyar genetik kimi təhsil alıb.
Tədqiqatçı: Dr Koh genetik dəri xəstəlikləri, o cümlədən EB ilə xüsusi maraqlanan pediatrik dermatoloqdur. O, DEBRA Sinqapurun qurulmasına kömək etdi və tez-tez EB olan xəstələri idarə etmək üçün bölgənin digər pediatrik dermatoloqları ilə əməkdaşlıq edir.
“Bəzi hallara klinik diaqnoz qoyula bilsə də, üst-üstə düşən və yaşa bağlı təqdimatlar konkret tipin dəqiq diaqnozunu qoymağı çətinləşdirir. EB-də genetik diaqnozun əldə edilməsi spesifik alt tipin dəqiq diaqnozunu qoymağa imkan verəcək ki, bu da uzunmüddətli proqnoz və simptomların düzgün idarə edilməsi üçün vacibdir... Genetik mutasiyanın müəyyən edilməsi həm də ağır hallarda prenatal testlər və bioloji testlərin ailəvi testləri üçün vacibdir. qohumları ilə əlaqə saxlayır və ailə planlaşdırılması ilə bağlı qərarlar qəbul edir”.
– Doktor Tan
Qrant adı: Uzun müddət oxunan ardıcıllıqla epidermoliz büllozunun genetik diaqnozunun təkmilləşdirilməsi.
Epidermoliz Bullosa (EB) dərinin kövrəkliyi ilə xarakterizə olunan, kiçik travma zamanı qabarcıqlara və eroziyaya səbəb olan nadir bir xəstəlikdir. Müəyyən EB növlərində çapıqlar blisterlərə və eroziyalara görə baş verə bilər. Dəridən başqa, EB ağız, yemək borusu, mədə-bağırsaq sistemi, sidik yolları və gözlər kimi epitellə örtülmüş selikli qişalara da təsir edə bilər. Bu toxumalarda çapıqlar əmələ gələ bilər ki, bu da striktura kimi əlavə fəsadlara səbəb olur. EB həmçinin anemiya, zəif böyümə və ortopedik problemlər kimi digər ağırlaşmalara, həmçinin skuamöz hüceyrəli karsinoma kimi bəzi dəri xərçəngləri riskinin artmasına səbəb ola bilər. EB-nin bütün dörd əsas növü (EB simpleks, qovşaq EB, distrofik EB və Kindler sindromu) genetik anormallıqlardan qaynaqlanır.
EB ciddilik spektri və üst-üstə düşən təqdimatlarla klinik cəhətdən heterojen olduğundan, xüsusilə həyatın ilk illərində əsas növləri, eləcə də 30-dan çox klinik alt tipləri ayırd etmək çətin ola bilər. Uzunmüddətli nəticələrin proqnozlaşdırılmasına və müvafiq müalicəyə rəhbərlik etməyə kömək etmək üçün qəti diaqnoz üçün molekulyar təsdiq edilməlidir. Genetik testlər vasitəsilə müsbət nəticə əldə etməkdə müvəffəqiyyət nisbəti tək genli Sanger və ya çox genli qısa oxunan ardıcıllığın mövcud üsulları üçün 50-90% arasında dəyişir. Uzun müddət oxunan ardıcıllıq çoxlu EB genlərini araşdırmaq üçün geniş şəkildə istifadə edilməmişdir. Nanopore uzun oxunma texnologiyası DNT-nin uzun fraqmentlərini ardıcıllıqla sıralaya bilər ki, bütün genin daha tam ardıcıllığı daha dəqiq diaqnozu təmin edərək, əsas genetik mutasiyaların aşkarlanmasında daha yaxşı nəticə verə bilər.
Müxtəlif növ EB-nin klinik xüsusiyyətləri üst-üstə düşə bilər və tez-tez həyatın erkən dövründə diaqnostik dilemma yaradır. Erkən və dəqiq genetik testlər EB alt növünün operativ diaqnostikasına gətirib çıxara bilər ki, bu da daha yaxşı proqnozlaşdırma və təkmilləşdirilmiş idarəetmə, habelə fəsadların proqnozlaşdırılması və monitorinqini təmin edir.
Hal-hazırda, genetik test çoxlu genin və ya ekzomun (genomun gen ehtiva edən bölgələri) eyni vaxtda ardıcıllıqla ardıcıllıqla aparılır, adətən qısa fraqmentləri ardıcıllıqla sıralayır. Daha uzun fraqmentlərin (kodlaşdırılmayan bölgələr daxil olmaqla) nanopore ardıcıllığı potensial olaraq daha yüksək diaqnostik məhsuldarlıqla nəticələnə bilər və daha çox genetik variantları aşkar edə bilər. Müsbət genetik nəticə əldə etmək xəstələr üçün vacibdir. Şiddətli pediatrik hallarda, gələcək hamiləlikdə valideynlər və yardım üçün bağlanma vacibdir. Probandda genetik variantın müəyyən edilməsi həm də geniş ailə üçün riskin qiymətləndirilməsinə imkan verir. Genetik qüsur haqqında məlumat həmçinin EB-nin resessiv formaları üçün daşıyıcı testi üçün istifadə edilə bilər, burada iki qüsurlu allel hər iki valideyndən miras alınır və onların hər biri qüsurlu surət daşıyır. Prenatal və ya pre-implantasiya testləri üçün EB-nin dominant formaları üçün spontan mutasiyaları müəyyən etmək üçün genetik testlər də aparıla bilər.
EB simptomlarının altında yatan klinik xəstəliyin gedişatını daha yaxşı başa düşmək üçün, genetik məlumatları xəstəlik təqdimatları ilə daha yaxşı əlaqələndirmək üçün bir çox xəstədə müəyyən edilməli olan daha çox genetik varianta ehtiyacımız olacaq. Daha çox genetik variantların aşkarlanması həm də xəstəliyin patogenezi zamanı molekulyar proseslərin daha yaxşı başa düşülməsinə səbəb olardı ki, bu da yeni farmakoloji vasitələrin və digər müalicə üsullarının inkişafına səbəb ola bilər.
Mən genetik səbəbi olan xəstəliklərin əsaslarını açmaqda maraqlı olan bir genetikam. Müstəntiqim EB ilə xüsusi maraqlanan dermatoloqdur. O, EB xəstələrinin diaqnostikası və idarə edilməsində yerli həkimlərlə işləmək üçün digər Cənub-Şərqi Asiya ölkələrinə səfər edərək yerli EB icmasında və həmçinin regionda fəal olmuşdur. Genetik pozğunluqların molekulyar anormallıqlarını müəyyən etmək üçün genetik ardıcıllıqdan istifadə etdik. Qısa oxunan texnologiyadan (məsələn, Illumina və Ion platformaları kimi) istifadə edərək gələcək nəsil ardıcıllığı indi yaxşı qurulmuşdur və klinik praktikada standart qayğıya çevrilmişdir, lakin onun müəyyən edə biləcəyi genetik anormallıqlar çərçivəsində məhdudiyyətlər vardır. Qısa oxunan ardıcıllıqla qaçırılan genetik anormallıqları, o cümlədən daha böyük silmələr, daxiletmələr və dublikasiyaları aşkar etmək üçün daha yeni uzun müddət oxunan ardıcıllıq texnologiyası üzərində işləyirik.